西苑医院病理科成立于1978年，前身为基础医学研究所病理室。建科之初，仅有一名医师和一名技师，经过多年发展，在院领导的支持下，在全科人员共同努力下，不断发展，已经成为集医疗、科研和教学相结合的重要医技科室。目前病理科有10名工作人员，诊断医师4名，技师6名。其中具有高级职称人员3名，中级职称4名，初级职称3名。拥有博士学位3人，硕士学位3人，学士学位4人。科室人材梯队建设稳步推进。
   科室设立了诊断室、常规病理技术室、冰冻切片室、免疫组化室、荧光原位杂交室和分子实验室等。开展的项目包括常规病理诊断、术中快速冰冻病理诊断、免疫组织化学染色、分子病理等。常规病理年外检量近2万例。开展免疫组化项目100余种，基本均为免疫组化仪自动化染色。每年细胞学检查12000余例。病理科拥有先进的医疗仪器设备，包括多台单头及多头显微镜，冰冻切片机，全自动染色机，罗氏荧光PCR仪，液基细胞学制片系统及朗珈病理学管理信息系统。大部分设备均与病理系统对接，实现从取材到切片的全程标准化和可溯性，提供更好的质控条件。

科研方面，结合本院的中医特色和优势学科，积极开展胃癌前病变的科研工作，与临床科室和基础实验中心密切协作，每年完成科研病理服务30余项，我科主持和参与了国家自然基金重点项目、面上项目、科技部十三五支撑计划以及首都临床特色应用研究、中医科学院科技创新工程等科研课题20余项，发表学术论文近百篇。