中国中医科学院西苑医院男科成立于1992年，是我国较早成立的男科专科之一，国家中医药管理局高水平中医药（男科）重点学科建设科室。现拥有4名高级职称，7名中级职称医师，其中博士生导师2名，硕士生导师4名，博士后合作导师2名，享受国务院政府特殊津贴专家1名，国家中医药领军人才--岐黄学者1名，中国中医科学院首席研究员1名，中国中医科学院中青年名中医1名，首都中青年名中医1名，国家公派访问学者2名。是中国中医药信息学会男科分会、北京中西医结合学会男科专业委员会挂靠单位及临床、科研、教学培训基地。在中医药防治男性不育症、良性前列腺增生、早泄曾获得中国中西医结合学会科技进步奖一等奖、中国民族医药协会科技进步奖一等奖等省部级奖6项，

科室以中医、中西医结合诊疗为主，以心身同调，整体与局部同治为治疗新目标，以提高患者安全和疗效为宗旨，突出中医特色为导向。应用中医、中西医结合治疗前列腺炎、良性前列腺增生、前列腺癌、男性不育症、男性性功能障碍、精索静脉曲张、血精症、附睾炎、阴茎硬结症、PSA升高、泌尿生殖系感染、男性更年期综合征、男性青春期发育迟缓等男科疾病有明显优势和特点。科室承担国家自然基金课题等20余项，协定处方22个，发表相关文章300余篇，授权国家专利10多项，牵头制订行业指南与共识16个。

为方便患者个体化诊治，每周设有肾虚专病、尿频专病、少弱精子症、前列腺疾病、男性不育症、阳痿、早泄、精索静脉曲张等专病门诊，科室年门诊量8万余人次，2023年位居北京地区男科门诊前列，是北京地区临床、科研、教学规模最大男科之一，患者来自全国各地及欧美各国，在国内外具有一定影响力。科室技术力量雄厚，医疗特色明显，集临床、科研、教学、保健、科普为一体。科室拥有精子质量自动分析仪、Rigiscan阴茎硬度测定仪、数字振动感觉阈值检查仪、MMS尿流率仪、红外治疗仪等设备。建科30多年以来，一直承担着为基层医院培养人才的任务，以及中国中医科学院、北京中医药大学、滨州医学院等多所高等院校的临床实习工作，每年接受20余人次来我科学习和进修。为满足基层的人才需求，根据一些省市自治区卫生厅或中医管理局的要求，已为河北省、山东省、吉林省、福建省、四川省、山西省、重庆等16个省市培养学术带头人50余人。