西苑医院作为临床教学基地，承担了北京中医药大学部分院系本科生以及长学制学生的临床教学和毕业实习等教学任务。临床教学方面，在教育处的统一部署下，各教研室主任均担任主讲，并选派各科临床经验丰富、责任心强、工作在一线的中青年骨干教师担任教学和带教工作，师资力量强大。临床实习方面，教育处采取轮转入科室的方式培养学生的实践能力，轮转科室包括内、外、妇、儿、针灸、骨伤、推拿等各科，很好的培养了学生中医临床思维和操作能力。