西苑医院脾胃所坚持“突出中医药特色、发挥中西医结合优势”，潜心笃志、砥身砺行，临床与科研齐头并进，秉承“中医有特色、西医不落后”的指导方针，在消化系统疾病的临床医疗、科研与教学等方面取得了卓越的成绩。目前，脾胃所由肝病科、脾胃病科、普外科组成。

脾胃病科是西苑医院最早成立的内科科室之一，具有悠久的历史和深厚的学术积淀，自1955年建院以来，黄坚白、徐季含、步玉如、施奠邦、周建中等众多享誉国内外的脾胃病名家为脾胃病学科的发展及人才培养奠定了坚实的基础。科室现为卫健委脾胃病重点专科，国家中医药管理局脾胃病重点专科、重点学科，北京市中医脾胃病研究所（2013年），国家中医药管理局脾虚重点研究室（2015年），脾胃病专科区域诊疗中心、胃癌前病变中西医临床协作平台及脾胃病重点专科协作组组长单位，为中国中医科学院、北京大学、北京中医药大学、中医及中西医结合硕士、博士研究生培养基地和博士后流动站专业基地。

科室拥有一支高素质的专科人才团队，人才梯队合理，现有医生19名，高级职称14人，学科带头人为国际欧亚院士、岐黄学者唐旭东教授，科室主任为王凤云主任医师。科室设有病房、门诊、内镜中心、胃肠动力室、消化实验室，设备先进，技术全面，目前拥有病床数32张，年均门诊量11万人次以上。科室重视中医理论的传承，结合现代技术不断创新，突出中医药治疗特色，以慢性胃炎及其癌前病变、胃食管反流病（反流性食管炎）、溃疡性结肠炎、肠易激综合征、急性胰腺炎等消化难治病为优势病种进行中医药治疗，临床疗效显著，同时结合中药膏摩、耳穴、泡脚等多种中医非药物治疗，诊治能力和疗效水平广受患者好评。

科研方面，以通降理论、脾虚理论、调中复衡理论为指导、以优势病种疗效评价研究、诊疗方案规范化与标准化、中药复方疗效作用机制研究、院内制剂与中药新药研发为重点内容，先后承担国家重点基础研究计划（973计划）、国家重点研发计划、国家十一五、十二五、十三五科技支撑计划、国家重大新药创制项目、国家中医药管理局行业科研专项、国家自然科学基金重点及面上项目、北京市十病十药等课题60余项，总研究经费达9000余万元；发表学术论文360余篇，其中SCI论文39篇；出版专著14部；获得发明专利3项、计算机软件著作权4项，获中华中医药学会科技进步一等奖2项，中国中西医结合学会科技进步一等奖1项、北京市科技进步奖及其他奖项5项。入选国家中医药管理局中医药防治难治病传承和创新团队、中国中医科学院创新团队。

科室拥有通降颗粒、胃舒胶囊、固肠胶囊、健胃定痛胶囊等多个有效院内制剂，研发了国内第一个治疗非糜烂性反流病的复方中成药通降颗粒，2018年以1000万转让武汉健民药业，自主研发的治疗腹泻型肠易激综合征的复方中药制剂肠安I号，2020年以1000万转让河北以岭药业。